Badanie ultrasonograficzne przeprowadzane przy użyciu wysokiej jakości sprzętu umożliwia fizjoterapeucie dokonanie dokładnej oceny aktywności mięśni, naderwań czy też zerwań ich włókien, a także zlokalizowanie i zmierzenie wielkości krwiaków, które podczas tych uszkodzeń występują. Dzięki USG można również badać strukturę ścięgien, ich niestabilność, podwichnięcia, zbliznowacenia oraz inne zmiany patologiczne. Na tego typu badaniu widoczne są także przerwania ciągłości okostnej towarzyszące złamaniom i zapaleniom kości, wyrośla kostne i skostnienia pozaszkieletowe. W obrębie stawów fizjoterapeuta może dokonać oceny jakości chrząstki stawowej wykrywając na wczesnym etapie jej zwyrodnienie, ocenić niestabilność stawu wynikającą z uszkodzenia, naderwania lub zerwania więzadeł, a także zlokalizować obecność wysięku w stawie. Na badaniu USG wyraźnie widoczne są również uszkodzenia nerwów związane z ich stłuczeniem, czy też naciągnięciem oraz zmiany patologiczne w postaci nerwiaków.

Oprócz diagnostyki urazów w obrębie narządu ruchu przed terapią ultrasonograf umożliwia fizjoterapeucie także wykonywanie badań kontrolnych w trakcie jej prowadzenia oraz po jej zakończeniu. Śledzenie postępów terapeutycznych, a także poprawa efektywności procesu usprawniania z użyciem ultrasonografu nazywana jest sonofeedbackiem. Wykorzystywany jest on do motorycznego nauczania ruchu, dzięki któremu fizjoterapeuta najpierw identyfikuje, a następnie wyizolowywuje pracę odpowiednich grup mięśniowych. Przykładem sonofeedbacku jest aktywizacja mięśnia poprzecznego brzucha w terapii dolegliwości bólowych odcinka lędźwiowego kręgosłupa oraz praca z mięśniami dna miednicy u pacjentów z problemem nietrzymania moczu.